COVID-19 detekteringstip

For at støtte påvisning af ny coronavirus (COVID-19) og vaccineundersøgelse og -udvikling har de amerikanske centre for sygdomskontrol og -forebyggelse (CDC) og den kinesiske regering afsluttet sekvensbestemmelse af det nye coronavirusgenom og forelagt resultaterne til den amerikanske NCBI GenBank ® database]. For nylig har IDT modtaget forespørgsler fra forskere over hele verden om det nye koronavirus-påvisningssæt. Følgende er en kort beskrivelse.

Amerikanske centre for sygdomskontrol og -forebyggelse

US Centers for Disease Control and Prevention Test Kit * Målretter mod forskellige steder på COVID-19 nucleocapsid-proteingenet (N-gen). De tre sæt primere / prober i dette sæt skal køres samtidig med den interne kontrol, der er rettet mod det humane RNase P-gen. I alt 4 qPCR-test er påkrævet for hver patientprøve.

1. Detektionssættet bruger en et-trins qPCR-reaktion (det vil sige omvendt transkription og efterfølgende qPCR-reaktioner er afsluttet i det samme trin);

2. Alle 3 N-gentest kan kun betragtes som et positivt resultat, når Cq 0010010 lt; 35;

3. RNase P's interne kontrolreaktion er nøglen. Cq 0010010 gt; 3 5 betyder, at prøveekstraktionen ikke er god, og eksperimentet skal gentages;

Se de seneste amerikanske centre for sygdomsbekæmpelse og -forebyggelse COVID-19 RT-PCR testmetode Laboratory Guide for relevante dokumenter og eksperimentelle protokoller.

Sammenligning med andre testsæt

Verdenssundhedsorganisationen (WHO)

Verdenssundhedsorganisations eksperimentelle program adskiller sig fra de amerikanske centre for sygdomskontrol og forebyggelse af eksperimentelt program. Verdenssundhedsorganisationen anbefaler tre qPCR-reaktioner for at bekræfte, om COVID-19 er inficeret. Selvom dette er et komplet sæt eksperimentelle protokoller, er der ingen amerikansk CDC-testmetode, der er hurtigere, fordi den kræver tre på hinanden følgende tests, og et positivt resultat skal overholdes inden den næste test. Den eksperimentelle protokol testes i følgende rækkefølge:

1. Coronavirus E-gen

2. RdRP-gen: målretning mod SARS-coronavirus og anden flagermus-associeret coronavirus

3. RdRP-gen: målretning mod COVID-19

Kinesisk Center for Bekæmpelse og Forebyggelse af Sygdomme

Detektionssættet fra det kinesiske center for sygdomskontrol og -forebyggelse anbefaler brug af 2 sæt primere / prober. Gruppe 1 er mål mod ORF 1 ab, og gruppe 2 bruges til at bekræfte N-genet fra COVID-19.

Kontrolgruppe

Foreløbig elektronisk simuleringsanalyse viser, at kombinationen af ​​IDT N-gen-positiv kontrolskabelon ** og det amerikanske CDC-testkit ligner brugen af ​​primer / probesæt fra det kinesiske CDC, det thailandske ministerium for sundhed, og HKU. De opnåede resultater ved eksperimentet er ensartede. Dette er naturligvis baseret på elektronisk simuleringsundersøgelse, og det anbefales, at brugerne verificerer det valgte sæt i deres eget laboratorium.

For mere information, se www.idtdna.com/pages/landing/coronavirus-research-reagents