J Comput Biol: En ny metode til at forudsige målet om antivirale stoffer eller vacciner

En ny metode til at forudsige de mest lovende antivirale lægemidler eller vaccinemål er baseret på de konformationelle ændringer, som virale glycoproteiner oplever under genkendelse og binding til værtsceller. Denne forudsigelsesmetode er rettet mod hovedkæden hydrogenbinding af det højeste frit energi motiv. Relaterede forskningsresultater offentliggøres i Journal of Computational Biology, som er et peer-reviewet tidsskrift udgivet af Mary Ann Liebert.

Robert Penner er formand for Rene Thom for det franske institut for videregående uddannelser (Bures-sur-Yvette) og UCLA matematisk biologi. Han er forfatteren af ​​denne artikel med titlen 0010010 quot; Backbone Free Energy Estimator anvendt på virale glycoproteins 0010010 quot;

Billedkilde: Mary Ann Liebert, Inc., forlag

Når virussen kommer ind i værtscellen og absorberes, gennemgår virussen normalt kraftig rekombination, hvilket danner et fusions- / infiltrationsmotiv. Penner foreslog en generel metode til at forudsige stærkt konformationelt aktive rester fra den tredimensionelle struktur af virale glycoproteiner. Metoden inkluderer analyse af proteinets hydrogenbindinger og beregning af de frie energiforskelle i de tilsvarende egenskaber for at bestemme de områder, hvor den konformationelle ændring mest sandsynligt vil forekomme. Metoden foreslået i dette papir bruges i øjeblikket til pigglycoprotein fra SARS CoV-2, som kan forårsage COVID-19.

Misha Gromov fra Institute of Advanced Science og New York University sagde: 0010010 quot; En matematisk idé fører direkte til en praktisk betydning, som ganske enkelt er et mirakel, men belønningen er enorm, fordi den forekommer i Maxwell {{1 }} # 39; s elektromagnetiske feltteori - det bringer radio og tv, åbner døren til teoretiske beregninger i vores digitale verden. 0010010 quot; Han er en berømt matematiker og vinder Abel Prize (også kendt som Nobelprisen i matematik). 0010010 quot; Kun når dens forfatter er en fremtrædende matematiker, men også har en bred videnskabelig horisont, er en sådan idé mulig, og dette er sjældent blandt de bedste matematikere i vores tid. Robert Penner er en så sjælden matematiker, han fandt, at metoden til proteinstrukturmønster er forskellig fra nogen anden i verden, og proteinstrukturmønsteret er resultatet af ren matematisk tænkning. Denne metode vil sandsynligvis spille en rolle og fremskynde udviklingen af ​​antiviruslægemidler eller vacciner. Men kun eksperimenter kan bevise dette. 0010010 citat (Bioon.com)

kilde: